Wie geht Zukunft? – Schulungsmaterialien zu Next-Generation-Sequencing (NGS) im Rahmen der Surveillance und zur Unterstützung bei Ausbruchsuntersuchungen

Die hochauflösende Ganzgenomsequenzierung mittels Next-Generation Sequencing (NGS) ist heutzutage die Genotypisierungsmethode der Wahl zur Überwachung (Surveillance) und Ausbruchsaufklärung von Infektionserregern.

Die genomische Surveillance von zoonotischen Infektionserregern ist essentiell um zu verstehen wie diese Erreger entstehen und sich ausbreiten. Sie bietet somit eine Grundlage für effiziente Präventionsmaßnahmen.

In Deutschland fehlt bislang ein systematisches und koordiniertes nationales Konzept zur Einführung einer integrierten genomischen Surveillance in die Routineversorgung. In dem Projekt „Integrierte Genomische Surveillance von Zoonoseerregern (IGS-Zoo)“ [1] wird ein Konzept zur NGS-basierten genomischen Surveillance in Deutschland erarbeitet und erprobt.

Ein wesentlicher Bestandteil dieses Projektes ist die Förderung des Verständnisses der genomischen Surveillance sowie die Steigerung der Akzeptanz und der Ausbau der Nutzung von NGS-basierten Daten im Öffentlichen Gesundheitsdienst (ÖGD) und in der Lebensmittelüberwachung.

Zu diesem Zweck wurden Schulungsmaterialien erstellt, die auf einer digitalen Lernplattform in Form von interaktiven Lerneinheiten genutzt werden können. Die Materialien ermöglichen es den Teilnehmenden, sich in kurzweiligen und thematisch kleinen Einheiten in die für den ÖGD relevanten Grundlagen zur NGS-basierten genomischen Surveillance einzuarbeiten und die Anwendungsmöglichkeiten von NGS zur Ausbruchsaufklärung kennenzulernen und zu üben.

Der Kurs richtet sich sowohl an Personen ohne Vorkenntnisse, die noch keine Berührung mit dem Thema hatten, als auch an Fortgeschrittene, die ihr Wissen auffrischen und ergänzen möchten. Ziel des Kurses ist es, sowohl die Möglichkeiten als auch die Grenzen von NGS-basierten Daten kennenzulernen, um somit einschätzen zu können, wo der Einsatz arbeitserleichternd ist. Absolventen des Kurses werden abschließend in der Lage sein:

• Situationen, in denen NGS eine Hilfe ist, zu erkennen

• NGS-basierte Daten (z.B. cgMLST-basierte Stammbäume/Grafiken) zu interpretieren und Befunde zu verstehen

• relevante Daten, Proben und Kontrollen zu identifizieren

• abzuschätzen, ob weitere Proben/Analysen zur Klärung des Ausbruchs nötig sind

• relevante Player, deren Aufgabenbereiche und Rahmenbedingungen (finanzielle Kosten, Zeitmanagement) zu benennen

• die Relevanz und Notwendigkeit von NGS zu erklären

Im Rahmen des BVÖGD-Kongresses möchten wir die digitale Lernplattform vorstellen.

Interessenskonflikte Es besteht kein Interessenkonflikt

Publikationsverlauf

Artikel online veröffentlicht:
26. April 2022

• Literatur

• 1 Universität Münster, Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR), Robert Koch-Institut (RKI), Niedersächsisches Landesgesundheitsamt (NLGA)