Differentielle Expression von mRNAs und miRNAs während der Progression des Mammakarzinoms

Zielsetzung:

Die Analyse molekularer Mechanismen beim Übergang vom duktalen in situ Karzinom (DCIS) der Brust zum invasiven duktalen Karzinom (IDC) trägt zum Verstehen der Vorgänge bei der Tumorprogression bei.

Die Ziele dieses Projektes sind die Identifizierung und Validierung von miRNAs und mRNAs, die (1) zwischen DCIS und IDC differentiell exprimiert sind und die (2) aggressive DCIS mit einem hohen Potential für invasives Wachstum detektieren.

Materialien und Methoden:

Er wurden (a) 15 in Formalin fixierte und in Paraffin eingebettete (FFPE) Mammakarzinom-Gewebeproben mit „reinem„ DCIS ohne IDC-Komponente von Patientinnen selektiert, die fünf Jahre lang kein Rezidiv aufwiesen, und (b) 15 FFPE-Gewebeproben mit DCIS- und IDC-Komponenten (DCIS/IDC-Tumore). Die Gewebeschnitte wurden durch einen Pathologen charakterisiert und die Tumorzellen mittels Lasermikrodissektion (LCM) isoliert. Die Gesamt-RNA wurde extrahiert und auf bead chip-Plattformen der Firma Illumina hybridisiert. Die bioinformatische Analyse erfolgte mit der GeneSpring GX Software (Agilent). Die Expression ausgewählter miRNAs und mRNAs wurde mittels qRT-PCR in unabhängigen Gewebeproben validiert.

Ergebnisse:

Zwischen „reinen“ DCIS und DCIS aus DCIS/IDC-Tumoren sind 700 Transkripte und 32 miRNAs differentiell exprimiert; zwischen DCIS und ihren assoziierten IDC sind dies 691 Transkripte und 16 miRNAs. In der qRT-PCR bestätigt sich ein kontinuierlicher Expressionsanstieg von Mmp11 von „reinen„ DCIS über DCIS der DCIS/IDC-Tumoren zum IDC. Zwischen DCIS und ihren assoziierten IDC lassen Thbs2, Cspg2, Krt14, und Pleckhc1 als differentiell exprimiert bestätigen. Hsa-miR-214 and hsa-miR-199a sind im Vergleich zum DCIS im IDC hochreguliert.

Zusammenfassung:

Die identifizierten RNAs könnten als mögliche prognostische Marker dienen und zum Verstehen der biologischen Mechanismen bei der Tumorprogression beitragen.